تختص اليخوت السلطانية بتوفير و تجهيز وسائل النقل البحري الخاصة بالكفاءة العالية ، وتتولى اليخوت السلطانية قيادة الرحلات البحرية التي يقوم بها المقام السامي حفظه الله ورعاه إلى الدول المختلفة ، وكذلك تنظيم وإدارة الرحلات البحرية للضيوف الرسميين متى ما صدرت توجيهات بذلك ، وتضم اليخوت السلطانية إسطولاً خاصاً من اليخوت والسفن والقوارب المبحرة ، والتي كان لها مشاركات مختلفة على المستوى الدولي كسفينة الإسناد السلطانية فلك السلامة والبغلة السلطانية زينة البحار.